GHGA Sommerschule: Gene Set Enrichment Analysis in R
- 02 Jun 2025 - 05 Jun 2025
GHGA Sommerschule zum Thema Gene Set Enrichment Analysis in R
Datum: 2nd - 5th June 2025
Ort: Meeting room 4th floor Mathematikon (Berliner Str. 41 69120 Heidelberg)
Kursleitende: Zuguang Gu (DKFZ) and Kübra Narci (GHGA)
Inhalt:
Die Gen-Set-Anreicherungsanalyse (GSEA) ist eine grundlegende Technik in der Analyse biologischer Daten. Sie wird häufig verwendet, um biologische Funktionen mit einer Liste von Genen in Verbindung zu bringen und bietet wertvolle Einblicke in den biologischen Kontext von experimentellen Ergebnissen. Dieser Workshop bietet eine umfassende Einführung in GSEA-Methoden mit praktischen Übungen unter Verwendung von R und Bioconductor-Paketen. Folgende Themen werden behandelt:
- Zugriff und Nutzung von Gen-Set-Ressourcen mit Bioconductor-Paketen;
- ORA und GSEA,
- Anwendungen von GSEA in der Genomik;
- Pfad-basierte GSEA-Ansätze;
- Einzelproben-GSEA-Ansätze und
- Visualisierung von GSEA-Ergebnissen.
Empfohlene Zielgruppen: Masterstudierende, Promovierende und Postdoc mit R-Kenntnissen.
Die Veranstaltung ist kostenlos, aber mit begrenzten Plätzen!