GHGA Vorlesungsreihe: Janet Kelso (virtuell)

• 27 Sep 2023

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Janet Kelso vom Max-Planck-Institut für evolutionäre Anthropologie sprach im Rahmen der GHGA-Vorlesungsreihe ("Advances in Data-Driven Biomedicine") am 27. September 2023 über "The impact of gene flow between archaic and modern humans". Dieser Vortrag wird auf Englisch gehalten.

Abstrakt:

The genomes of archaic and early modern humans offer a unique window into their histories. However, the sequencing and analysis of DNA from archaic humans is complicated by DNA degradation, chemical modifications and contamination. Recent technological advances have made it possible to recover nuclear DNA sequences from a number of archaic and early modern humans and a number of important insights have been obtained from the whole genome sequences that have been generated. Comparison of archaic genome sequences to the genome sequences of present-day humans has allowed us to identify sequence differences that have come to fixation or reached high frequency in modern humans since their divergence from Neandertals and Denisovans, some of which may have important functional effects in modern humans.  Further, ancient genomes have provided direct evidence that interbreeding between archaic humans and early modern humans occurred and that it resulted in between 1-6% archaic human DNA in the genomes of present day non-Africans. This introgressed DNA has been shown to have both positive and negative outcomes for present-day carriers: underlying apparently adaptive phenotypes as well as influencing disease risk.  I will discuss recent work in which we have identified Neandertal haplotypes that are likely of archaic origin and determined the likely functional consequences of these haplotypes using public genome, gene expression, and phenotype datasets. 

Biographie:

Janet Kelso leitet die Forschungsgruppe Computational Ancient Genomics am Max-Planck-Institut für evolutionäre Anthropologie in Leipzig, Deutschland, und ist gemeinsam mit Matthias Meyer Direktorin der Ancient DNA Core Facility des Instituts. Ihr Forschungsschwerpunkt liegt auf der Analyse alter Genome, insbesondere der Genome archaischer Menschen. Ihre Gruppe interessiert sich besonders für die Entwicklung neuer Berechnungsmethoden für die Analyse alter DNA und für die Anwendung dieser Methoden, um Einblicke in die Evolution von Genomen zu gewinnen. Janet promovierte in Bioinformatik am Nationalen Bioinformatik-Institut Südafrikas an der Universität Westkap unter der Leitung von Professor Winston Hide. Zusammen mit Alfonso Valencia ist sie Mitherausgeberin der Zeitschrift Bioinformatics und Chefredakteurin der Zeitschrift Database. Janet ist seit vielen Jahren aktives Vorstandsmitglied der International Society of Computational Biology und wurde 2015 zum Fellow der Gesellschaft ernannt.